一阶段：起步
2010年，中国的电商行业还是一个刚刚兴起的年轻行业，各个电商平台大多存在于概念期，少部分付诸行动的也都处在摸索阶段，各类促销活动开展得如火如荼，但是电商与物流行业的发展密不可分，当时的物流系统非常零散混乱，每每遇到电商大型促销活动，仓储和系统便瘫痪。
因为仓储和物流依靠的是纯粹的人力，那时没有流水线、没有条码扫描，也不具备仓储管理系统的路径优化测算能力，所以人工筛选分拣货物的速度并不足以满足需求，效率低下。
这一阶段的WMS系统基本等同于进销存软件，这是电商WMS一阶段。
二阶段：信息实时更新
后来，经济越来越发达，商品的品种日渐增加，再加上订单数量、库房商品种类等方面的急剧增加，每个月的周转率都超三倍，现在仅仅依靠人工管理的方法已经无法完成物流和仓储的工作量。
当时WMS的改造主要解决的问题有两个，一是货位管理，二是信息实时更新。在这一阶段内，国产WMS不断进行自我升级改造。
通过货位编码、出入库扫描、智能拣选等功能的实施，基本解决了以上问题，库房管理基本顺畅，库房仓储情况逐渐变好。
三阶段：分仓管理
在电商发展到一定规模后，需要在全国建立分仓以便降低物流成本和提高配送时效，这一阶段WMS系统的任务是完善联网和分仓管理的功能。
通过联网，电商ERP系统与各个分仓实现对接，公司根据历史销售记录做出预估，合理分配各个分仓的入库量，并及时下达出库指令，各个分仓之间后期需要根据销售情况进行商品调配。
此时WMS需要展现的不只是库存和销售订单，电商要实现订单可视化，需要WMS与TMS (系统运输管理系统)的配合。在库房里商品按库存数量管理，经过分拣和打包后，形成一个个配送订单，该订单信息上传到TMS系统，经由TMS系统持续跟踪快递包裹。
顾客通过APP可以及时知道自己的订单配送情况，就是大家在天猫、京东等APP上看到的“查看物流”选项。
由于规模的扩大，自有库房远不能满足自身发展需要，因此公司就会引入第三方物流运作，俗称3PL。
这些公司通过EDI与公司WMS实现数据共享，方式有两种，一是使用公司的WMS相当于分仓权限，二是第三方有自己的WMS其库存数据推送给公司WMS，但是看不到其操作过程。
四阶段：物流云仓
为了适应电商发展趋势，以顾客为导向，加快配送和退换货时效，提高顾客满意度，各大电商平台和快递企业纷纷提出了物流云仓模式，比如菜鸟云仓、京东云仓、顺丰云仓等。
其主要是以仓储为点，以互联网为基础，整合现有运营单一的仓库，形成全国性网络，开放给电商企业和快递公司入驻，并通过大数据、云计算等信息技术实现商品智能入库、智能化分单、优选派送、物流数据分析等